私もトラックバックとコメントの違いがいまひとつ、はっきりしないです。

機能的に違うのはわかっているつもりなのですが、
利用者から考えたらたいして違わないのかなぁとも思います。
　コメント　　　：相手の記事と、自分のサイトのリンク
　トラックバック：相手の記事と、自分の記事のリンク
って感じなんですよね。たぶん。。。

トラックバックはコメントである。あなたのサイトではなく誰か別の人のサイトに残されたコメントだけれども、コメントには違いない。Movable Typeが登録項目コメントとトラックバックを分けているのは不自然に感じられるし、トラックバックのpingデータがMovable Typeサイトのコメント部分の中に表示されるほうが意味があるように私には思われる。